台湾陆委会指中国大陆声称主导对日抗战，进而举办九三阅兵，目的是要在国际上强化中国大陆的“一中原则”论述，并强调对日抗战期间，中华人民共和国根本不存在。

陆委会在中国大陆九三阅兵前夕（9月2日）于脸书发文称：“中共近年来一再扭曲史实，声称主导对日抗战，进而举办‘九三阅兵’等系列活动，目的是要在国际上强化其‘一中原则’的论述，错误连结联合国大会2758号决议文，意图消灭矮化中华民国、捏造台湾归属于中华人民共和国”。

陆委会续称：“但中华民国对日抗战期间，中华人民共和国根本不存在。”

陆委会再次说明政府政策立场，强调禁止台湾的中央与地方政府现职人员出席中国大陆九三阅兵及大陆官方主导的相关活动。曾任国防、外交、大陆事务或与国安相关机关的台湾特定身份人员，依法不得参与大陆党政军所举办的庆典与活动，“而有妨害国家尊严之行为”。

陆委会警告，倘有台湾政党、法人、人民团体或个别人士赴陆参加相关活动，涉及与大陆从事任何形式的合作行为，主管机关将依两岸条例等相关法律规定裁罚。

台湾《自由时报》早前报道，熟稔国安问题的官员受访时称：“只要指标性人物去九三阅兵，我们就会依法查办。”大陆国台办回应时说，台湾各界代表人士赴京参加抗战胜利80周年纪念活动，是秉持民族大义的体现，是坚持正义良知的体现，堂堂正正，无可非议。

国台办也说：“民进党政府对此如临大敌，百般阻挠、威胁恐吓，完全丧失民族立场，背弃正义和良知，严重违背两岸同胞意愿，严重伤害两岸同胞感情，充分暴露其‘台独’本性，卑鄙龌龊，令人不齿。”

针对国台办的言论，陆委会回应时说，依两岸条例，曾任国防、外交、大陆等事务要职的指标性人员不得参与中国大陆所举办的庆典或活动，并欢迎台湾民众踊跃参加台湾国防部、退辅会等中央政府机关陆续将举办的对日抗战、古宁头大捷、823炮战等纪念活动。